El Museo Judío se encuentra en la casa Wertheimer, un edificio histórico, el nombre del húngaro Rabí Samson Wertheimer (desde 1658 hasta 1.724). La decisión sobre la base del Museo Judío de Eisenstadt se hizo en 1969 en el foro del Instituto de Estudios Judaicos en la Universidad de Viena. El museo fue inaugurado tres años más tarde, en 1972.

El Museo Judío se encuentra en una superficie de casi 1.000 metros cuadrados. metros y se divide en varias salas de exposiciones.

Durante su visita al museo se puede ver una sinagoga privada, situada en la primera planta del edificio. Esta pequeña sinagoga es uno de los pocos que no ha sufrido durante la "Kristallnacht" (o "Noche de los cristales rotos") en noviembre de 1938. Fue el primer ataque a gran escala de los nazis contra los Judios. Esa noche fue una ola masiva de pogromos en el territorio del Tercer Reich, fue destruido 267 sinagogas, mataron 91 Judios, cientos de heridos y mutilado, miles fueron sometidos a humillaciones e insultos, más de 30.000 fueron enviados a campos de concentración.

Además, el museo ofrece para familiarizarse con su exposición permanente ofrece un panorama completo de la vida judía y la historia de los Judios en Burgenland. Al final de la exposición es una impresionante sala conmemorativa, creado en memoria de las siete comunidades judías conocidas en Burgenland.

Además, el museo cuenta con una biblioteca, que contiene más de 10.000 volúmenes. Algunos de los libros están en la exposición permanente del museo, básicamente, este es el libro del siglo 18. Además, la biblioteca tiene una gran colección de ediciones facsimilares de libros famosos. De particular interés es una valiosa colección de libros en yiddish.

El museo está ubicado en Untershtadt (Ciudad Baja), donde a partir de 1670 se establecieron unos 3.000 Judios fueron expulsados ​​de Viena. No muy lejos del museo hay dos antiguo cementerio judío.