La idea de la creación del Museo Arqueológico de la ciudad de Almería se ha planteado en la primera mitad del siglo 19. Por 1.837 de los más cercanos a la ciudad y sus alrededores monasterios logrado retirar 196 pinturas y monedas antiguas y lápidas, joyas y utensilios, que data de la época de la dominación árabe en España. Pero para un número de causas desconocidas de apertura del museo en ese momento no tuvo lugar. Posteriormente, muchos de estos artefactos hicieron la colección del museo fuera de Almería e incluso en el extranjero.

Proclamación de la Segunda República Española fue el hecho de que en 1933 en Almería sigue abierto Museo Arqueológico, que se encuentra en el edificio del Instituto de Investigación. La colección inicial de los restos arqueológicos del museo encontrados durante las excavaciones en Almería y sus alrededores. En 1934, el museo ya se ha iniciado la cooperación con otras colecciones de los museos del país. En 1979, en relación con la ampliación de la colección del museo fue trasladado al edificio, que alberga el Colegio de Santa María la Virgen del Mar.

En 1998 por los arquitectos Ignacio García Pedrosa y Ángela García de Paredes se construyó un nuevo edificio del museo que cumple con las exigencias modernas. El interior del nuevo edificio, amplias y luminosas gracias a un elaborado sistema de iluminación natural, un diseño minimalista, unas claras líneas geométricas y la capacidad espacial. Colección del Museo Arqueológico de Almería son expuestos desde el Paleolítico hasta la dominación musulmana de la Península Ibérica.