Recorrido por el parque de Ueno conducen necesariamente invitado de la capital japonesa en el Museo Nacional de Naturaleza y Ciencia, que se encuentra en la parte noreste del parque. La exposición incluye más de 14 mil objetos y habla sobre el origen del mundo en general y, en particular, el archipiélago japonés, así como sobre los cambios que han ocurrido en su historia desde el principio hasta el día de hoy.

El museo fue inaugurado en 1871 y desde entonces ha cambiado varios nombres - que era el Ministerio de Educación y Museo y Museo de Tokio, mientras que en 2007 no ha adquirido su nombre actual. A finales del siglo XX y el comienzo de este siglo, el museo ha pasado por la modernización. Su edificio principal fue declarada patrimonio cultural de la nación, ahora es la galería japonesa, también hay 3D-cine "Theater 360". El nuevo edificio del museo está abierto global de la galería. Antes de entrar en el museo instalado en una figura de una ballena azul en tamaño completo.

Seis pisos de la Galería Global hablan de la evolución de la vida en la tierra, las leyes de la naturaleza, el origen de los dinosaurios y la diversidad de especies. Secciones separadas se dedican al desarrollo de la ciencia y la tecnología, y los representantes del mundo animal. El jardín se encuentra en el techo de la galería, el aumento de cerca de 160 especies de hierbas medicinales y aromáticas, y hay sombrillas, que se describen en el acercamiento del hombre a ellos. En la galería, los visitantes son libres de mantener o conseguir una experiencia física en una madera interactiva.

Galería japonesa se encuentra en el antiguo edificio principal, construido en el año 1930. Aquí está lo que era el archipiélago japonés durante la Edad de Hielo, se puede ver una colección de minerales, meteoritos, fósiles, aprender acerca de los animales que habitan en las islas del archipiélago, para averiguar lo que eran el equipo agrícola con. Una sección aparte se dedica al papel de arroz en la vida de Japón.

3D-cine "Theater 360", que se encuentra en el mismo edificio, fue entregado al museo después del final de la exposición internacional "Expo-2005", en la que se presentó por primera vez a los visitantes del pabellón de Japón. Esta pantalla transparente esférica con un diámetro de 12, 8 metros. Este tamaño fue elegido: la figura - aproximadamente una millonésima parte del diámetro de nuestro planeta. El número 360 en el nombre de cine es el ángulo de visión. La audiencia en el cine en el centro de la esfera, y sus películas cúpula proyectan sobre el origen del universo, los dinosaurios y los continentes. Cuatro de ellos fueron creados por el personal del museo.