Según la leyenda, el nombre "montaña Misharin" viene de un cierto empleado Munekhin Misyura, que vivió en la primera mitad del siglo 16, que era conocido por su trabajo de caridad en relación con las iglesias de Dios. Etnógrafo autorizada Okulich Casarin-NS en lugar de la versión más plausible del origen del nombre del templo, desde pequeños pantanos, llevaba el nombre mshary, ya que es este tipo de pantanos en algún momento de la antigüedad y estaba rodeado de una montaña.

La construcción de la iglesia de piedra se produjo en 1547. Inicialmente, la iglesia fue el monasterio. El libro de registros Scribe en 1623 menciona el monasterio de los hombres con las montañas Misharin Kotelnikovo. Esto es lo que está escrito en el monasterio de la de toda Rusia Chetyah Mina Metropolitan Macario. Se especula que el abad del monasterio de Nyquist durante los años 60 del siglo 16 fue Vassili Barlaam, que es el autor de la vida de Alexander Nevsky, Pskov Evfrosina.

En 1808, el templo fue destinado a la demolición como una muy antigua, pero aún así el Santo Sínodo no dio su consentimiento a esta acción. En 1882, un comerciante de la puerta principal de Pskov Stehnovskim Pedro Mijáilovich se construyó una casita de piedra. Durante los años 1892-1896 se llevaron a cabo trabajos de restauración en el mayordomo de caja - Kafelnikov Ivan Mikhailovich - ciudadano honorario de la ciudad de Pskov. La iglesia tiene dos tronos, la principal de las cuales es el trono del evangelista y apóstol Juan el Teólogo, y el segundo se llama en nombre de la Santa Mártir Juan el Guerrero. Durante los años 1786-1808 la iglesia fue asignado a vzvoz George Templo, y en 1934 fue acreditado con la iglesia de los Santos Apóstoles emperador Constantino y su madre, la reina Helena.

El campanario de la iglesia fue construida al mismo tiempo con la construcción del templo de San Juan Bautista. La campana colgada seis campanas. En la parroquia hay tres capillas, construidas en madera: San Nicolás el Milagroso, y cerca de la aldea Hryastolovo Santo Mártir Anastasia y San Mártir Anastasia.

La iglesia de San Juan Bautista existía hospicio, custodia parroquial, el hospital, pero una escuela parroquial nunca se construyó. A finales del siglo 19 en un pueblo llamado Cabra Brod fue construida por la escuela parroquial de la iglesia, pero pronto, en 1895, debido a la proximidad a otras escuelas de la ciudad que estaba cerrado.

A lo largo del perímetro de toda la iglesia es un cementerio en el que están enterrados el historiador y etnógrafo Tsvylёv SA, Smirnov VP restaurador y los soldados que murieron durante su servicio de combate.

Desde 1913, el templo sirvió como sacerdote Kolobov Fedor. En 1927, después de que fue arrestado varias veces, Fedor fue exiliado a los Urales. Kolobov esposa le siguió, entonces ninguna información sobre ellos se ha informado. Acólito, diácono era Mikhail Lebedev, pero su posterior vida nada se sabe.

23 de diciembre 1936, se decidió cerrar la iglesia, pero según otras fuentes, el servicio continuó hasta la Segunda Guerra Mundial. Durante la guerra, el templo ha recibido algún daño a las paredes, techos, interiores y exteriores. Durante los años 1970-1989 por el arquitecto V. Lebedev Se ha llevado a cabo una completa restauración de la iglesia. 03 de marzo 1965 el cementerio de la iglesia estaba cerrada para los entierros.

El primer servicio se inició en 1992 con la entrada del templo. El renacimiento de la Iglesia de San Juan Bautista está estrechamente entrelazada con el nombre de un famoso abad de Jonás. Contribuir a la restauración de la iglesia y director de la Pskov Cable Plant Viktor Kukushkin.
En 2001, el arzobispo Pskov Eusebio hace consagró ocho campanas, que fueron emitidos en Voronezh en el camino antiguo. Hoy en la escuela dominical de la iglesia e hizo la oficina de la peregrinación, que recibió el estado de la diócesis.