La primera universidad de Pécs surgió en 1367 como una de las más antiguas de Europa Central del rey Luis el Grande, que se hundió durante la ocupación turca. En 1921 el ex Universidad húngara en Bratislava (se Bratislava, húngaro:. Pozsony) se trasladó a Pécs, Janus Pannonius es rezultatom1982 Universidad (Janus Pannonius Tudományegyetem, JPTE).

  La primera universidad fue fundada en Pécs por Luis I de Hungría en 1367. Después de haber existido como un centro educativo unificado desde hace varias décadas, en el medio del siglo 15 se divide en dos escuelas - derecho y teología. Durante la ocupación turca de la universidad fue cerrada y abierta sólo en 1785, cuando José II trasladó la Real Academia de Gyor, Pecs. En 1802, la Real Academia se produjo en Gyor por orden de Francisco I, y las instituciones de educación superior en Pec no fue hasta 1833, cuando el obispo de Pécs, bajo los auspicios del senado de la ciudad fundada en Pec Academia con las facultades de derecho y filosofía.

  Moderna de la Universidad de Pécs fue fundada en 1912 y originalmente ubicado en Pozsony (ahora Bratislava). Después de la Primera Guerra Mundial fue Pozsony aneksirovan de Hungría, y en 1921 se trasladó a la Universidad de Pécs, donde permanece hasta nuestros días. En 1951, la Facultad de Medicina de la Universidad se ha separado, y hasta el año 2000 era una institución independiente. En 1982, la Universidad fue nombrado después de Janus Pannonius. Esta Universidad de Pécs se estableció el 1 de enero de 2000 hasta la fusión de la Universidad Pannonius Jano, la Universidad de Medicina y Teachers College.