La construcción del nuevo edificio del monasterio de Santa Clara de Coimbra fue lanzado en 1649. Monasterio Viejo, construido a finales del siglo XIII, fue destruida, y se decidió construir un nuevo edificio para las monjas de la Orden de Santa Clara.

El proyecto ha desarrollado un monje benedictino del monasterio y el arquitecto real João Turriano, a cargo de la construcción del arquitecto real Mateus do Couto. Nueva construcción duró lo suficiente. En 1677 un nuevo edificio del monasterio, que se conoció como el Monasterio de Santa Clara-a-Nova, condujo monjas. En 1696 fue consagrada la iglesia.

El principal portal de la iglesia del monasterio está decorado con el escudo de armas real, que es apoyado por dos ángeles. El interior de la iglesia es de estilo barroco. La iglesia de una sola nave, crucero no se encuentra. Las capillas laterales y la capilla mayor está decorada con 14 retablos del siglo XVII en el estilo de "Talya dorado" - retablos enmarcadas en madera tallada y dorada. Además, un nuevo monasterio se trasladó la tumba con los restos de la reina Isabel de Portugal, el fundador del monasterio. Tras la muerte de su marido, el rey Dinis, la Reina estaba en Coimbra convento de Santa Clara hasta su muerte y fue enterrado allí. Por lo tanto, entre los lugareños este monasterio se llama el monasterio de la reina Isabel. La tumba de cenizas, de plata y cristal, situado cerca del altar mayor de la iglesia. Antes de la iglesia se encuentra un monumento a la reina Isabel, por el escultor Antonio Teixeira Lopes en el siglo XIX.

En 1733 en el claustro del monasterio fueron construidas en el estilo renacentista. La construcción de estas galerías a cargo del arquitecto húngaro Carlos Mardel.